Музей был образован Министерством здравоохранения Республики Беларусь в 1990 году. Экспозиция для широкой публики открыта в мае 1993 года.
В экспозиции музея представлены самобытные средства народной медицины и, конечно же, научные подходы к лечению.
Отдельное место в экспозиции занимают материалы посвященные древним религиозным верованиям и злым духам, приносящим болезни. Чтобы защититься от духов, люди использовали амулеты и поклонялись валунам. Увидеть как из себя выглядят валуны, можно в уникальном парке-музее валунов.
В фонде музея хранится свыше 25 тыс. уникальных экспонатов. Особенную ценность представляют редкие документы, фотографии, медицинская литература, мединструменты, награды и личные вещи практиков по охране здоровья Беларуси.
В экспозиции музея собраны картины и диорамы, посвященные медицинской теме. Одна из картин, например, запечатлела сдачу экзамена в университете Падуи первого доктора медицины в Беларуси Франциска Скорина.
Музей поделен на несколько отделов каждый отдел посвящен отдельной теме связанной с медициной.
Основные направления деятельности музея — просветительская работа, организация выставок, историко-медицинские исследования и сбор новых экспонатов.
